Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha12Q91Y18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha12Q91Y18 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms