Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usb1Q91W78 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usb1Q91W78 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usb1Q91W78 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms