Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacng8Q8VHW2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacng8Q8VHW2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacng8Q8VHW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms