Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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