Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap2Q8VC34 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms