Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf13Q8K2W6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phf13Q8K2W6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms