Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd3Q8K2C9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd3Q8K2C9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms