Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700001C19RikQ8K168 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700001C19RikQ8K168 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700001C19RikQ8K168 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms