Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms