Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc159Q8C963 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc159Q8C963 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc159Q8C963 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc159Q8C963 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc159Q8C963 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc159Q8C963 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms