Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ubqln3Q8C5U9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubqln3Q8C5U9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubqln3Q8C5U9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubqln3Q8C5U9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubqln3Q8C5U9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ubqln3Q8C5U9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ubqln3Q8C5U9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubqln3Q8C5U9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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