Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933409G03RikQ8C5U0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms