Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd55Q8BLD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms