Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop53Q8BK35 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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