Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms