Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Frmd3Q8BHD4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd3Q8BHD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms