Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
AW551984Q8BGF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AW551984Q8BGF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AW551984Q8BGF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms