Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pja2Q80U04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms