Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SugctQ7TNE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms