Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cand1Q6ZQ38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cand1Q6ZQ38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cand1Q6ZQ38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms