Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp8b3Q6UQ17 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b3Q6UQ17 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
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