Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil2Q6R2P8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil2Q6R2P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms