Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm29Q6PDI5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm29Q6PDI5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms