Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb40Q6PCS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms