Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NipblQ6KCD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NipblQ6KCD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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