Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Thsd7aQ69ZU6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Thsd7aQ69ZU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7aQ69ZU6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms