Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Knl1Q66JQ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Knl1Q66JQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms