Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms