Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpaQ62189 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpaQ62189 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms