Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Astn1Q61137 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Astn1Q61137 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Astn1Q61137 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Astn1Q61137 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Astn1Q61137 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Astn1Q61137 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Astn1Q61137 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms