Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf235Q61116 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf235Q61116 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf235Q61116 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf235Q61116 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf235Q61116 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms