Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc27a1Q60714 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a1Q60714 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a1Q60714 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms