Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms