Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme4Q5SSW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme4Q5SSW2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme4Q5SSW2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psme4Q5SSW2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme4Q5SSW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms