Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim7Q5RKS2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms