Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mdc1Q5PSV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdc1Q5PSV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms