Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rapgef6Q5NCJ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rapgef6Q5NCJ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms