Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc1Q5NCF2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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