Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkaa1Q5EG47 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms