Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pacs2Q3V3Q7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pacs2Q3V3Q7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms