Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Pydc3Q3V3Q4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pydc3Q3V3Q4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Pydc3Q3V3Q4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pydc3Q3V3Q4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms