Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87499Q3UX49 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms