Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl4Q3URY0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms