Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec31aQ3UPL0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec31aQ3UPL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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