Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc33Q3ULW6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms