Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms