Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms