Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srebf2Q3U1N2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srebf2Q3U1N2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms