Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy4Q3TYX8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy4Q3TYX8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms