Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1lQ2KN98 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms